This in invention relates to methods for the nucleic acid amplification of multiple variants (strains) of any pathogen present in a sample, and preferably in a sample from a pathogen infected individual. In preferred embodiments, the pathogen is a retrovirus, such as HIV. The amplified pathogen nucleic acid can be used to identify the pathogen variants present in a sample, to quantitate the pathogen present in a sample, and as a nucleic acid vaccine, or in the preparation of antigen presenting cell vaccines. Nucleic acids produced by the methods of the invention or the proteins encoded thereby can be used to transfect/load antigen presenting cells. The loaded antigen presenting cells can then be used as a vaccine for the treatment of pathogen infection. In another embodiment, nucleic acids produced by the methods of the invention can be used directly as nucleic acid vaccines without prior loading into antigen presenting cells.Linvention concerne des procédés pour amplifier des acides nucléiques de nombreuses variantes (souches) dun pathogène présent dans un échantillon, et de préférence dans un échantillon provenant dun individu infecté par un pathogène. Dans des modes de réalisation préférés, lagent pathogène est un rétrovirus, tel que le VIH. Lacide nucléique pathogène amplifié peut être utilisé pour identifier les variantes pathogènes présentes dans léchantillon, pour quantifier lagent pathogène présent dans un échantillon, et comme un vaccin dacide nucléique ou dans la préparation de vaccins à cellules présentant des antigènes. Les acides nucléiques produits par les procédés de linvention ou le protéines codées par eux peuvent être utilisés pour transfecter /charger des cellules présentant des antigènes. Les cellules présentant des antigènes chargés peuvent être utilisés comme un vaccin dans le traitement dune infection pathogène. Dans un autre mode de réalisation de linvention, des acides nucléiques produits selon les procédés de linvention peuvent être utilisé