The present invention relates to a method of obtaining fatty acids with a concentrated DHA comprising: a) a step of converting oil containing DHA into fatty acids; b) a step of manufacturing a mixed solution of the fatty acids obtained in step a) and ethanol; c) a step of adjusting an initial moisture content of the mixed solution at a range of 0-5 wt%; d) a step of adding 2.5-10 wt% of enzymes to the mixed solution obtained in step c); e) a step of injecting carbon dioxides at a pressure of 2.8-13.8 MPa into a reactor; f) a step of performing a reaction for 2-24 hours while performing stirring; and g) a step of obtaining reactants by lowering pressure to atmospheric pressure while slowly exhausting carbon dioxide from the reactor.본 발명에 의하여 a) DHA를 포함하는 오일을 지방산으로 전환하는 단계; b) 상기 a)단계에서 수득한 지방산과 에탄올의 혼합액을 제조하는 단계; c) 상기 혼합액의 초기 수분함량을 0-5중량%로 조정하는 단계; d) 상기 c)단계에서 수득한 혼합액에 효소를 2.5-10중량% 첨가하는 단계; e) 반응기 내에 2.8 내지 13.8 MPa의 압력으로 이산화탄소를 주입하는 단계; f) 교반하면서 2 내지 24시간동안 반응시키는 단계; g) 반응기 내에서 서서히 이산화탄소를 빼면서 압력을 상압으로 내려 반응물을 취하는 단계를 포함하는 DHA가 농축된 지방산을 얻는 방법이 개시된다.