An association of a pre-operative plan and tracked position and orientation of a surgical instrument relative patient anatomy in a navigation system is generated. The pre-operative plan includes a virtual representation of the patient anatomy data. Position and orientation of the patient anatomy as well as position and orientation of the surgical instrument within the navigation system is obtained. A virtual representation of the surgical instrument relative the virtual representation of the patient anatomy data is generated in multiple orientations in separate parts of a split window. A system with a tracker comprising a tracker interface for attaching the tracker to the instrument includes a surgical navigation module for generating the virtual representation in a split window.La présente invention concerne un procédé et un système comprenant la génération d'une association d'un plan pré-opératoire et de la position et de l'orientation suivies d'un instrument chirurgical par rapport à l'anatomie du patient dans un système de navigation. Le plan pré-opératoire comporte une représentation virtuelle des données anatomiques du patient. La position et l'orientation de l'anatomie du patient ainsi que la position et l'orientation de l'instrument chirurgical sont obtenues à l'intérieur du système de navigation. Une représentation virtuelle de l'instrument chirurgical concernant la représentation virtuelle des données anatomiques du patient est générée dans plusieurs orientations dans des parties séparées d'une fenêtre divisée. Un système avec un suiveur comportant une interface de suiveur pour fixer le suiveur à l'instrument comprend un module de navigation chirurgicale pour générer la représentation virtuelle dans une fenêtre divisée.
