公开了一种合成的FMD肽免疫原和包含所述免疫原的组合物。还公开了使用所述合成的FMD肽免疫原在动物中检测、治疗与预防FMD感染的方法。在一个具体实施方案中，描述了一种针对口蹄疫(Foot and Mouth Disease)的基于肽的紧急疫苗及其制剂。不同的疫苗制剂含有源自FMDV VP1蛋白的肽的混合物；各个肽包含连接于人工Th表位的B细胞FMDV中和/受体结合表位序列，以增强各个肽的免疫原性。所公开的含有病毒免疫原的疫苗制剂，可以任选地补充以表示源自FMDV蛋白的FMDV内源性Th表位、同源物及其功能类似物的肽混合物。在可接受的递送系统中将此种病毒肽组合物制成疫苗制剂，并且可以仅单次施用即可保护猪和牛在FMDV攻击时免受感染。
