The present invention relates to a manufacturing method of a natural antioxidant citron ferment liquid, which comprises the following processes of: (1) cutting the whole citron fruit containing a citron seed in a predetermined size (2) mixing a citron fragment in the (1) process with unrefined sugar cane raw sugar as a catalyst capable of extracting a nutrient component of the whole citron fruit, wherein in case of necessity, a portion of the unrefined sugar cane raw sugar can be substituted with oligosaccharide (3) naturally fermenting a mixture in the (2) process in an eco-friendly breathing pottery for a long period of time more than one year and (4) stably and easily extracting and drinking the whole important nutrient component such as vitamin, mineral, organic acid, or the like of the citron fruit containing a strong antioxidant material such as polyphenol, limonoid, or the like which is an important containing component of a seed that is the most important portion of the citron fruit with an eco-friendly manner.COPYRIGHT KIPO 2018본 발명은1) 유자열매의 씨앗을 포함한 유자열매 전체를 일정 크기로 절단하여,2) 동 유자열매 전체의 영양성분을 추출해낼 수 있는 촉매제로서 비정제 사탕수수 원당(필요시 일부를 올리고당으로 대체가능)을 1)항의 유자절편과 혼합한 후,3) 2)항의 혼합물을 숨쉬는 옹기인 친환경 옹기에 담아 장기간 동안(1년 이상)의 자연발효과정을 통해4) 유자열매의 가장 중요한 부분인 씨앗의 중요함유성분인 폴리페놀 및 리모노이드 등 강력한 항산화물질을 포함한 유자열매의 중요영양성분(비타민,미네랄,유가산 등) 전체를 친환경적이고 안정적이며 용이하게 추출하여 음용할 수 있는 천연 항산화 유자발효원액의 제조방법에 관한 것임