本发明涉及抗GST标签蛋白的纳米抗体及应用,其含有的VHH链由框架区FR和互补决定区CDR组成,其中,架区FR区包括下组的FR的氨基酸序列:SEQ ID NO:1所示的FR1、SEQ ID NO:2所示的FR2、SEQ ID NO:3所示的FR3以及SEQ ID NO:4所示的FR4,互补决定区CDR区包括下组的CDR的氨基酸序列:SEQ ID NO:5所示的CDR1、由SEQ ID NO:6示的CDR2、以及由SEQ ID NO:7所示的CDR3。本发明还包括抗GST标签蛋白的纳米抗体的应用。本发明的抗GST标签蛋白的纳米抗体分子小,易表达,亲和力高,可溶性好,稳定性强,免疫原性低。