本发明属生物工程领域,涉及一种新型β葡萄糖苷酶/木糖苷酶双功能纤维素降解酶RuBGX2及其编码基因与应用。RuBGX2的氨基酸编码序列包含SEQ ID NO 2序列第18-755位。RuBGX2来源于中国牦牛瘤胃微生物,通过对瘤胃宏基因组cosmid文库和亚克隆文库的功能筛选、测序分析获得编码一种新型β葡萄糖苷酶/木糖苷酶双功能纤维素降解酶RuBGX2的新基因。本发明的β葡萄糖苷酶/木糖苷酶双功能酶可广泛应用于纤维素的降解,包括纤维素生物转化、化工、纺织、食品、生物能源、饲料添加、医药工业方面应用等领域。利用本发明的RuBGX2双功能酶降解木质纤维,能够减少添加酶的种类,简化酶解工艺。