A method for deleting a region of DNA in a plant. In some embodiments, the method comprises transforming a plant with a nucleic acid molecule, wherein the nucleic acid molecule encodes one or more zinc finger nuclease(s) (ZFNs) operably linked to one or more tissue-specific promoter(s), e.g., a pollen-specific promoter. Methods include excising native genes in a plant. Accordingly, in some embodiments, ZFNs are engineered that recognize sequences that flank native plant genes. In further embodiments, ZFNs are expressed under the control of developmental stage-specific promoters, such that, for example, nucleic acid sequences are specifically excised in plants during relatively late stages of development. Nucleic acid molecules useful for carrying out disclosed methods and plants produced by the methods are included.L'invention porte sur un procédé pour la délétion d'une région d'ADN dans une plante. Dans certains modes de réalisation, le procédé comporte la transformation d'une plante avec une molécule d'acide nucléique, la molécule d'acide nucléique codant pour une ou plusieurs nucléases à doigt de zinc (ZFN) liées fonctionnellement à un ou à plusieurs promoteurs spécifiques de tissu, par exemple un promoteur spécifique de pollen. Les procédés comprennent l'excision de gènes natifs dans une plante. Par conséquent, dans certains modes de réalisation, les ZFN sont génétiquement modifiées et reconnaissent les séquences qui encadrent les gènes végétaux natifs. Dans d'autres modes de réalisation, les ZFN sont exprimées sous le contrôle de promoteurs spécifiques du stade de développement de telle sorte que, par exemple, les séquences d'acide nucléique sont excisées d'une manière spécifique dans des plantes à des stades relativement tardifs du développement. L'invention porte également sur des molécules d'acide nucléique utiles pour la mise en œuvre des procédés décrits, ainsi que sur des plantes obtenues par ces procédés.