一种检测基孔肯雅病毒抗体的重组抗原蛋白,所述重组抗原蛋白序列如SEQ ID NO.1所示,其编码基因序列如SEQ ID NO.2所示,该编码基因序列中包括编码重组抗原蛋白柔性臂的延伸区段,柔性臂能够消除表达载体的融合蛋白对多肽表位的掩盖,使表达的重组抗原蛋白正确折叠。本发明还公开了该重组抗原蛋白的制备方法。另外,本发明公开的基孔肯雅病毒的检测试剂盒中包含包被有上述重组抗原蛋白的抗体检测板和ELISA反应液。本发明的重组抗原蛋白具有特异性强、亲和力高的优点,与其它相近的虫媒传播病毒无血清学交叉反应,而与基孔肯雅病毒抗体具有极高亲和力,能够快速、准确地检测基孔肯雅病毒抗体,从而诊断基孔肯雅病毒的感染情况。