The present invention relates to a method for providing information on the diagnosis of depression using a methylation ratio of a promoter in an SLC6A4 gene, a serotonin transporter gene. The present invention contributes to evidence indicating a link between epigenetic gene regulation and structural brain changes in depression, and can provide information on the diagnosis of depression.본 발명은 세로토닌 전달체 유전자인 SLC6A4 유전자에서 프로모터의 메틸화 비율을 이용한 우울증 진단에 관한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 우울증에서 후생적 유전자 조절과 구조적 뇌 변화 사이의 연관성을 나타내는 증거에 기여하며, 우울증 진단에 관한 정보를 제공할 수 있다.