The disinfection method using the light diffusing fiber optically connects the light source with a light diffusing optical fiber having a core, a cladding surrounding the core, an outer surface, and a plurality of scattering structures located within the core, the cladding, or both the core and the cladding. It includes the step of. The method further includes optically engaging and positioning the light diffusing optical fiber with a pathogen sample, and directing the light output by the light source to the light diffusing optical fiber for a first time interval. The scattering structure scatters the light propagating along the light diffusing optical fiber toward the outer surface, and a part of the light is diffused through the outer surface, and at a wavelength of about 380 nm to about 495 nm for an exposure time of about 2 hours to about 24 hours. Pathogen samples are irradiated with light having an average power density of 5 mW/cm 2 to about 30 mW/cm 2 .광 확산 섬유를 이용하는 소독 방법은 코어, 상기 코어를 둘러싸는 클래딩, 외부 표면, 및 상기 코어, 클래딩, 또는 코어와 클래딩 모두 내에 위치된 복수의 산란 구조를 구비한 광 확산 광섬유로 광원을 광학적으로 연결하는 단계를 포함한다. 상기 방법은 상기 광 확산 광섬유를 병원체 샘플과 광학적으로 체결하여 위치시키는 단계와 상기 광원에 의해 출력된 광을 제1 시간 간격 동안 광 확산 광섬유로 지향시키는 단계를 더욱 포함한다. 상기 산란 구조는 외부 표면을 향해 광 확산 광섬유를 따라 전파되는 광을 산란시키고 광의 일부는 외부 표면을 통해 확산되어 약 2 시간 내지 약 24 시간의 노출 시간 동안 약 380 nm 내지 약 495 nm의 파장에서 약 5 mW/cm2 내지 약 30 mW/cm2의 평균 전력 밀도를 가진 광으로 병원체 샘플을 조사한다.