This system is a system for analyzing blood flow of a target vascular site by means of simulation, having a fluid analysis unit, by a computer, for determining state quantities of blood flow at each position of a lumen of the target vascular site by means of computation by imposing computational conditions including boundary conditions relating to the blood flow to three-dimensional shape data of the target vascular site; a three-dimensional shape modification unit for modifying the three dimensional shape data by simulating a surgical treatment method and for outputting the three-dimensional shape data after the modification; and a comparison display unit for displaying computed results of before and after the modification of the three-dimensional shape for comparing the results, by causing the fluid analysis unit to re-compute the state quantities based on the three-dimensional shape data after the modification.(해결수단)이 시스템은, 피험자의 대상혈관부위의 3차원 형상 데이터에 혈류에 관한 경계조건을 부여하고, 상기 대상혈관부위의 내강을 메쉬분할하고, 각 메쉬위치에 있어서의 혈류의 상태량을 연산에 의하여 구하는 혈류해석 시스템으로서, 이 시스템은, 컴퓨터가, 상기 대상혈관부위의 내강의 3차원 형상 데이터를 읽고, 상기 대상혈관부위에 포함되는 복수의 혈관요소를 그 각 혈관요소의 단면적의 크기에 의거하여 라벨링하는 라벨링부를 구비하고, 상기 단면적의 크기에 의거하는 라벨링에 의거하여 혈관요소별로 메쉬분할 상세도를 변동시켜서, 상기 상태량의 연산을 실행하는 것이다.