A system and method for counting follicular units using an automated system comprises acquiring an image of a body surface having skin and follicular units, filtering the image to remove skin components in the image, processing the resulted image to segment it, and filtering noise to eliminate all elements other than hair follicles of interest so that hair follicles in an area of interest can be counted. The system may comprise an image acquisition device and an image processor for performing the method. In another aspect, the system and method also classifies the follicular units based on the number of hairs in the follicular unit.La présente invention concerne un système et un procédé de comptage dunités folliculaires, le procédé consistant à acquérir une image dune surface corporelle comprenant de la peau et des unités folliculaires, à filtrer limage pour éliminer les composantes cutanées de limage, à traiter limage résultante pour la segmenter, et à filtrer le bruit pour supprimer tous les éléments autres que les follicules pileux dintérêt de sorte que les follicules pileux se trouvant dans une zone dintérêt sont comptés. Le système peut comprendre un dispositif dacquisition dimage et un processeur dimage permettant la mise en oeuvre du procédé. Dans un autre aspect de linvention, le système et le procédé permettent également de classifier les unités folliculaires selon le nombre de poils compris dans lunité folliculaire.