The present invention relates to methods for isolating Tr1 cells, resting Tr1 cells and/or activated Tr1 cells, to methods for enriching or depleting a cell population in Tr1 cells, resting Tr1 cells and/or activated Tr1cells and to methods and kits for treating chronic inflammatory diseases, autoimmune diseases, allergic diseases, cancer and organ transplantation conditions.La presente invención se refiere a métodos para aislar células Tr1, células Tr1 en reposo y/o células Tr1 activadas; a métodos para enriquecer o empobrecer en células Tr1, una población de células, células Tr1 en reposo y/o células Tr1 activadas, y a métodos y equipos para tratar enfermedades inflamatorias crónicas, enfermedades autoinmunológicas, enfermedades alérgicas, cáncer y condiciones de trasplante de órganos.