本发明公开了一种新型茎瘤芥miRNA在调控植物耐盐胁迫中的应用,所述茎瘤芥miRNA的成熟序列具有如SEQ ID NO.1所示的序列,其前体序列具有如SEQ ID NO.2所示的序列。本发明首次发现了茎瘤芥miR240,然后将miR240前体序列在植物中过表达后,通过盐胁迫处理实验发现,转基因幼苗耐盐胁迫的能力明显提高。通过本发明研究,表明miR240是耐盐的正调控因子,为通过分子手段提高植物抗逆性提供了新的基因资源。还为植物的非生物胁迫改良提供了一个关键基因,也为茎瘤芥新品种或其他植物新材料提供了有力的技术支持,对农业生产上实现优质、高产育种具有重要理论和应用价值。