The present invention relates to an IFN-α fusion protein in which cytoplasmic residual cell membrane permeation peptide (CTP) and polyethylene glycol (PEG) are bound to IFNα protein. The IFN-α fusion protein of the present invention maintains high intrinsic activity of interferon, prolongs half-life in vivo, and improves liver mobility. IFN-α fusion protein of the present invention can be used in the development of protein pharmaceuticals effective for the prevention or treatment of liver disease, including various viral infections.본 발명은 IFNα 단백질에 세포질 잔류성 세포막 투과 펩타이드(CTP)와 폴리에틸렌글리콜(PEG)이 결합된 IFN-α 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 IFN-α 융합 단백질은 인터페론의 고유활성이 높게 유지되며, 생체 투여시 반감기가 연장되고, 간 이동능이 향상된다. 본 발명의 IFN-α 융합 단백질은 각종 바이러스성 감염 등을 포함하는 간질환의 예방 또는 치료에 효과적인 단백질 의약품의 개발에 사용될 수 있다.