本发明公开了一种与大豆百粒重遗传特征相关的标记位点Sat145及其应用,属于大豆遗传技术领域。本发明所提供的专用引物是在大豆O连锁群上,紧密连锁标记为SSR引物Sat145,引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。该引物的标记位点为Sat145与大豆百粒重性状具有极显著地的相关性。该标记PCR产物的Sat145-3(480 bp)的片段是影响百粒重的主效位点。利用紧密连锁的分子标记检测育种群体家系及大豆种质资源,并进行数理统计分析证实该片段是主效位点,可预测其对百粒重性状的影响,大大提高了大豆高产育种的选择效率。