Provided is a mesenchymal stem cell separation method, comprising: A) utilizing collagenase to digest an animal sample, and dispersing cells contained in the animal sample to obtain a cell mixture comprising stem cells; B) introducing the nucleic acid molecule of encoded reporter protein into at least some of the cells of the cell mixture, the nucleic acid molecule of the encoded reporter protein being operably connected to the specificity promoter of the mesenchymal stem cell to express the reporter protein in the mesenchymal stem cell; and C) utilizing FACS to sort and obtain the mesenchymal stem cell expressing the reporting protein, the mesenchymal stem cell being a single cell.L'invention concerne un procédé de séparation de cellule souche mésenchymateuse consistant à : A) utiliser une collagénase pour digérer un échantillon animal et disperser les cellules contenues dans l'échantillon animal pour obtenir un mélange de cellules comprenant des cellules souches ; B) introduire la molécule d'acide nucléique de la protéine rapporteuse codée dans au moins certaines des cellules du mélange de cellules, la molécule d'acide nucléique de la protéine rapporteuse codée étant reliée fonctionnellement aux promoteurs de spécificité de la cellule souche mésenchymateuse pour exprimer la protéine rapporteuse dans la cellule souche mésenchymateuse ; et C) utiliser FACS (tri de cellules activées par fluorescence) pour trier et obtenir la cellule souche mésenchymateuse exprimant la protéine rapporteuse, la cellule souche mésenchymateuse étant une cellule unique.