A method for filtering a protein-containing liquid containing protein at a concentration of 20 mg / mL or more and 100 mg / mL or less, wherein the protein-containing liquid is a prefilter having a pore size of 0.08 μm to 0.25 μm and made of a hydrophobic resin. Including a pre-filtration step for filtration, and a virus removal step for filtering the protein-containing solution after the pre-filtration step with a virus removal membrane made of a synthetic polymer. A method comprising 0.25 g or more of a protein trimer or higher multimer having a diameter of less than 100 nm per 1 m 2 of a virus removal membrane.20mg/mL以上100mg/mL以下の濃度でタンパク質を含有するタンパク質含有液のろ過方法であって、タンパク質含有液を、孔径が0.08μmから0.25μmであり、疎水性樹脂からなるプレフィルターでろ過する前ろ過工程と、前ろ過工程後に、タンパク質含有液を、合成高分子からなるウイルス除去膜でろ過するウイルス除去工程と、を含み、前ろ過工程をされる前のタンパク質含有液が、平均直径が100nm未満であるタンパク質の三量体以上の多量体を、ウイルス除去膜1m2あたり0.25g以上含んでいる、方法。