Presented herein are efficient and reliable systems and methods for calculating and extracting three-dimensional central axes of bones of animal subjects - for example, animal subjects scanned by in vivo or ex vivo microCT platforms - to capture both the general and localized tangential directions of the bone, along with its shape, form, curvature, and orientation. With bone detection and segmentation algorithms, the skeletal bones of animal subjects scanned by CT or microCT scanners can be detected, segmented, and visualized. Three dimensional central axes determined using these methods provide important information about the skeletal bones.La présente invention concerne des systèmes et des procédés efficaces et fiables pour le calcul et l'extraction d'axes centraux tridimensionnels d'os de sujets animaux — par exemple, des sujets animaux analysés par des plateformes à micro-CT in vivo ou ex vivo — pour capturer les directions tangentielles tant générales que localisées de l'os, ainsi que sa forme, son profil, sa courbure et son orientation. Grâce à des algorithmes de détection et de segmentation osseuse, les os du squelette de sujets animaux analysés par des analyseurs à CT ou micro-CT peuvent être détectés, segmentés, et visualisés. Des axes centraux tridimensionnels déterminés au moyen de ces procédés fournissent des informations importantes concernant les os du squelette.