UNIVERSIDAD DEL PAIS VASCO - EUSKAL HERRIKO UNIBERTSITATEA (UPV/EHU)
发明人:
LEGARRETA SOLAGUREN, LEIRE,LEGARRETA SOLAGUREN, Leire,MARTÍNEZ FERNÁNDEZ, LUIS,MARTÍNEZ FERNÁNDEZ, Luis,MARTÍNEZ DE LA FUENTE MARTÍNEZ, ILDEFONSO,MARTÍNEZ DE LA FUENTE MARTÍNEZ, Ildefonso,MILANIC, MAR
申请号：
ESES2014/070888
公开号：
WO2015/082745A8
申请日:
2014.12.02
申请国别(地区):
WO
年份:
2015
代理人:
摘要：
The invention relates to a method for computer-assisted design of a vaccine against a disease which, on the basis of a plurality of amino acid chains S1...Sk obtained from patients infected with said disease and a set Τ of target epitopes, each epitope being an amino acid chain, includes the steps of: i) obtaining, by means of a combinatorial optimisation method, a plurality of amino acid chains having the shortest possible length relative to the combinatorial optimisation method used, which have as subchains at least one integer λ of epitopes from the set Τ in each of the sequences Si, wherein the value of λ is such that the length of the resulting chain is long enough to develop an immune response but not long enough to develop an autoimmune response ii) selecting, among the plurality of chains obtained in the preceding step, at least one final candidate for immunogen via at least one standard experimental method and iii) developing the vaccine from said immunogen.Procedimiento para el diseño computacional de una vacuna para una enfermedad que partiendo: - de una pluralidad de cadenas S1...Sk de aminoácidos obtenidas de pacientes infectados por dicha enfermedad y, - de un conjunto Τ de epítopos objetivo, siendo cada epítopo una cadena de aminoácidos comprende las etapas de: i) obtener mediante un método de optimización combinatoria una pluralidad de cadenas de aminoácidos de una longitud lo más corta posible respecto al método de optimización combinatoria utilizado que tengan como subcadenas al menos un número entero λ de epítopos del conjunto Τ en cada una de las secuencias Si, teniendo λ un valor tal que la longitud de la cadena resultante sea suficientemente larga para desarrollar una respuesta inmune, pero no tan larga como para desarrollar una respuesta autoinmuneii) seleccionar entre la pluralidad de cadenas obtenida en la etapa anterior al menos un candidato final a inmunógeno mediante al menos un método experimental estándariii) desarrollar la vacuna a par
