Imaging apparatus, among a plurality of horizontal lines belonging to the reading target area of the sensor section, the beginning pixels from the start of the exposure period of the horizontal lines for exposing a plurality of pixels on the horizontal line to be read is generated As one frame period until the reading of the pixel information is completed it is, for each illumination period having a length of at least two frame period, the plurality of in synchronism with the start of the exposure period of the horizontal lines to be read first from the sensor section While sequentially emits illumination light, is performed to exclude controlling the image data corresponding to pixel information of the sensor unit has read to the end of the one frame period of the illumination period from a predetermined processed and sensors other frame period of the illumination period Part is to acquire image data corresponding to the pixel information read out, the control is performed for performing a predetermined process.撮像装置は、センサ部の読み出し対象領域に属する複数の水平ラインのうち、初めに読み出される水平ライン上の複数の画素を露光するための露光期間の開始時点から該水平ライン上の各画素が生成した画素情報の読み出しが完了するまでを１フレーム期間として、少なくとも２フレーム期間分の長さを有する照明期間ごとに、センサ部から最初に読み出される水平ラインの露光期間の開始に同期して複数の照明光を順次出射し、照明期間の最後の１フレーム期間にセンサ部が読み出した画素情報に対応する画像データを所定の処理対象から除外する制御を行う一方、照明期間のその他のフレーム期間にセンサ部が読み出した画素情報に対応する画像データを取得し、所定の処理を施す制御を行う。
