The respiratory microbiomes of neonates and those with bronchopulmonary disease have been characterized. Provided are probiotic compositions, which can include at least one living bacterial strain and at least one killed bacterial strain, that can comprise a combination of Lactobacilli species, 5 that when delivered to the bronchi or lungs of a patient can provide a reduction in the symptoms of a bronchopulmonary disease.Les microbiomes respiratoires des nourrissons et ceux présentant une maladie broncho-pulmonaire ont été caractérisés. La présente invention concerne des compositions probiotiques, qui peuvent comprendre au moins une souche bactérienne vivante et au moins une souche bactérienne tuée, qui peut comprendre une combinaison d'espèces de Lactobacilli, qui lorsqu'elle est administrée aux bronches ou aux poumons d'un patient peut fournir une réduction des symptômes d'une maladie broncho-pulmonaire.