The present invention relates to a culturing system using a food chain structure, which comprises: a plurality of culturing tanks for breeding fish and shellfish a purification tank which is connected to an outlet of the culturing tanks to naturally purify breeding water a collection well which is connected to the purification tank to store the purified breeding water and a control means for an underwater environment which controls temperature, humidity, a dissolved oxygen amount, pH, EC, salinity, feed, CO_2, ventilation, intensity of illumination, time, intake and exhaust, a nutrient solution, and the condition of sterilization of the culturing tanks, and controls the flow of the breeding water. The culturing system using the food chain structure can reduce a contamination source of a water tank, and an amount of artificial feed.COPYRIGHT KIPO 2017본 발명은 어패류를 사육하는 복수 개의 양식 수조 상기 양식 수조의 배출구와 연결되어, 사육수를 자연정화시키는 정화조 기 정화조와 연결되어 상기 정화된 사육수를 저장하는 집수정 및 상기 복수 개의 양식 수조의 온도, 습도, 용존 산소량, pH, EC, 염도, 먹이, CO2, 환기, 조도, 시간, 흡.배기, 양액, 살균상태 및 사육수의 흐름을 제어하는 수중환경 조절수단을 포함하는 먹이사슬 구조를 이용한 양식 시스템에 관한 발명으로 수조의 오염원을 줄이고 인공사료의 사용량을 줄일 수