PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a medical image processing apparatus that can accurately estimate a blood flow rate, and provide an X-ray CT apparatus.SOLUTION: A medical image processing apparatus according to one embodiment comprises a first setting unit, a second setting unit, a determination unit and an analysis unit. The first setting unit sets a first interested area in an annular region corresponding to a cardiac muscle in a cardiac cross section included in image data. The second setting unit sets a second interested area wider than the first interested area to an area including the annular region. The determination unit determines a threshold for determining a signal value range for use in hemodynamics analysis to the image data, based on a frequency distribution of the signal value in the first interested area. The analysis unit executes hemodynamics analysis using the signal value included in the range based on the threshold concerning the second interested area.SELECTED DRAWING: Figure 1【課題】精度よく血流量を推定することができる医用画像処理装置及びX線CT装置を提供すること。【解決手段】実施形態に係る医用画像処理装置は、第1の設定部と、第2の設定部と、決定部と、解析部とを含む。第1の設定部は、画像データに含まれる心臓の断面において心筋に対応する環状領域に第1の関心領域を設定する。第2の設定部は、環状領域を含む領域に対して第1の関心領域よりも広い第2の関心領域を設定する。決定部は、第1の関心領域における信号値の度数分布に基づいて、画像データに対する血流動態解析に用いる信号値の範囲を定めるための閾値を決定する。解析部は、第2の関心領域について、閾値に基づく範囲に含まれる信号値を用いた血流動態解析を実行する。【選択図】図1