本发明公开了棉花丝/苏氨酸蛋白磷酸酶GhTOPP6及其编码基因和应用。本发明首先公开了如下任一所示的蛋白质在调控植物抗逆性中的应用:A1)氨基酸序列为SEQ ID No.1的蛋白质;A2)在SEQ ID No.1所示的氨基酸序列的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白;A3)将SEQ ID No.1所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与A1)所示的蛋白质具有90%以上的同一性且功能相同的蛋白质。本发明进一步公开了培育抗逆性增强的转基因植物的方法。本发明棉花GhTOPP6基因可以提高植物的抗逆性,为有效提高植物的耐盐性、抗旱性和ABA胁迫抗性奠定良好的分子基础。