本发明公开了一种烟草硝酸还原酶NIA1启动子、其表达载体及其应用。该NIA1启动子的核苷酸序列为:如SEQ ID NO.1所示序列;或在保留如SEQ ID NO.1所示序列的核心启动子序列的基础上,经去除或加倍调控NIA1表达的、与信号响应元件序列高度相似的关键元件;或由SEQ ID NO.1所示序列衍生的具有同等功能的核酸序列。一种具有NIA1启动子序列的用于植物遗传转化的真核表达载体。一种具有NIA1启动子序列的用于植物遗传转化的工程菌。NIA1启动子在启动目的基因表达中的应用,目的基因为GUS基因。本发明为验证NIA1启动子硝酸信号响应功能研究打下基础,对提高植物氮效率、节约氮肥用量以及发展资源节约型环境友好型农业具有广阔前景。