本发明公开了一个大豆花叶病毒SC18株系抗性基因GmNIK及其应用。基因GmNIK的cDNA核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其编码的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。利用菜豆荚斑驳病毒诱导的基因沉默技术(VIGS)对抗病品种科丰一号中的GmNIK基因进行沉默后接种SC18株系,抗病品种科丰一号出现坏死和花叶的感病症状。GmNIK被沉默后,抗病品种科丰一号对大豆花叶病毒SC18的抗性发生了变化,由抗病变为感病。证明了科丰一号的GmNIK基因决定了对SC18株系的抗性。利用转基因技术或分子标记辅助选择导入GmNIK基因有望提高大豆对大豆花叶病毒的抗性。