Provided is an endoscope system capable of setting an optimal balance of light source wavelengths according to a diagnostic purpose. The endoscope system includes a diagnostic purpose acquisition unit, a plurality of light sources having different emission wavelengths, a light amount ratio storage unit, a light amount ratio selection unit, and a light source control unit. The diagnostic purpose acquisition unit acquires a diagnostic purpose. The light amount ratio storage unit stores a correspondence relationship between a plurality of light amount ratios in which the balance of the emitted light amounts of the plurality of light sources is different and the purpose of diagnosis. The light amount ratio selection unit refers to the light amount ratio storage unit, and selects the acquired light amount ratio used for diagnostic purposes. The light source control unit controls a plurality of light sources to emit illumination light having a selected light quantity ratio.診断目的に応じて最適な光源波長のバランスを設定することができる内視鏡システムを提供する。内視鏡システムは、診断目的取得部と、発光波長が異なる複数の光源と、光量比記憶部と、光量比選択部と、光源制御部と、を備える。診断目的取得部は、診断目的を取得する。光量比記憶部は、複数の光源の各射出光量のバランスが異なる複数の光量比と、診断目的との対応関係を記憶している。光量比選択部は、光量比記憶部を参照し、取得された診断目的で用いる光量比を選択する。光源制御部は、複数の光源を制御し、選択された光量比の照明光を発光させる。