PROBLEM TO BE SOLVED To provide a medical image processing apparatus, a medical image diagnostic apparatus, and a medical image processing program which can facilitate analysis of a cross section in respiratory diseases.A medical image processing apparatus according to an embodiment includes a correction unit and an output control unit. The correction unit assumes a shape in a non-collapsed state with respect to a collapsed area which is a region of the image data of the predetermined cross section and is a region of the respiratory tubular organ which has collapsed, And performs shape correction. The output control unit outputs information on the collapsed area after the shape correction.BACKGROUND OF THE INVENTION【課題】呼吸器疾患における断面の解析を容易にすることが可能な医用画像処理装置、医用画像診断装置及び医用画像処理プログラムを提供することである。【解決手段】実施形態の医用画像処理装置は、補正部と、出力制御部とを備える。補正部は、所定断面の画像データに含まれる領域であって虚脱を起こした呼吸器系管状臓器の領域である虚脱領域に対して、非虚脱状態における形状を仮定し、前記仮定された形状に基づき形状補正を行う。出力制御部は、前記形状補正後の前記虚脱領域に関する情報を出力する。【選択図】図1