本发明属于生物技术领域,具体涉及一种串联优势表位的重组猪圆环病毒2型Cap蛋白及其应用。该串联优势表位的重组猪圆环病毒2型Cap蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示,编码上述蛋白的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明进一步构建了含有上述核苷酸序列的双启动子转移载体,并转化大肠杆菌,获得重组杆状病毒质粒;然后转染昆虫细胞,得到重组杆状病毒,其重组蛋白表达量达914μg/ml,能够与阳性血清发生特异性结合,具有良好的免疫学反应性。本发明提供的亚单位疫苗,免疫小鼠后能够刺激小鼠产生高水平的体液免疫应答;免疫仔猪后可诱导机体产生特异性免疫反应,能为攻毒仔猪提供良好的免疫保护作用。