The present disclosure provides a CasY protein, a nucleic acid encoding a CasY protein, and a modified host cell comprising the CasY protein and / or a nucleic acid encoding the same. CasY protein is useful for a variety of applications provided. The present disclosure provides a CasY guide RNA that binds to and provides sequence specificity to a CasY protein, a nucleic acid encoding a CasY guide RNA, and a modified host cell comprising a CasY guide RNA and / or a nucleic acid encoding the same To do. CasY guide RNA is useful for a variety of applications provided. The present disclosure provides methods for identifying CRISPR RNA-induced endonucleases.本開示は、CasYタンパク質、CasYタンパク質をコードする核酸、ならびにCasYタンパク質及び/またはそれをコードする核酸を含む改変宿主細胞を提供する。CasYタンパク質は、提供される多様な用途に有用である。本開示は、CasYタンパク質に結合して、CasYタンパク質に配列特異性を与えるCasYガイドRNA、CasYガイドRNAをコードする核酸、ならびにCasYガイドRNA及び/またはそれをコードする核酸を含む改変宿主細胞を提供する。CasYガイドRNAは、提供される多様な用途に有用である。本開示は、CRISPR RNA誘導型エンドヌクレアーゼを同定する方法を提供する。