本发明公开了一种调控黄瓜圆叶性状相关蛋白及其编码基因与应用,该蛋白的氨基酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示,PID基因编码丝氨酸/苏氨酸的蛋白激酶,属于AGC激酶家族,该蛋白的编码基因如序列表SEQ ID NO:1所示的碱基序列,该碱基序列在1092bp位的鸟嘌呤(G)被腺嘌呤(A)取代,编码的氨基酸残基序列的346位的Val(缬氨酸)突变为Met(甲硫氨酸),该蛋白抑制生长素极性运输,导致生长素运输极性缺陷,具体植株表型为叶边缘平滑,锯齿突出不明显,叶片呈近圆形;主根不发达,主侧根没有明显区别;雌雄花无花萼,雌花不育等。该基因及蛋白的发现,可以为黄瓜叶型改良、产量增加以及理想株型培育和生长素信号通路分子调控机制的研究提供基础。