The present invention relates to the field of complex peptides suitable for the manufacture of drugs with improved plasma half-life. In particular, the present invention relates to a complex protein obtained by an enzymatic reaction via microbial transglutaminase (MTGase), and a hydrophilic non-immunogenic polymer and enzyme at the glutamine side chain via an amide bond with microbial transglutaminase (MTGase). Improved methods for removing residual transglutaminase from chemically bound peptides or recombinant proteins, according to the method, wherein an amide-linked enzyme between a peptide or protein moiety and a hydrophilic polymer It is possible to obtain purified complex peptides or proteins that are stable to hydrolysis, and show no product-derived degradation and the necessary stability for the drug.本発明は、血漿半減期が改良された薬物の製造に適した複合ペプチドの分野に関するものである。特に、本発明は、微生物トランスグルタミナーゼ(MTGase)を介した酵素反応によって得られる複合タンパク質と、微生物トランスグルタミナーゼ(MTGase)によりアミド結合を介してグルタミン側鎖にて親水性非免疫原性ポリマーと酵素的に結合したペプチド又は組換えタンパク質から残留トランスグルタミナーゼを除去するための改良された方法とに関するものであり、該方法によれば、ペプチド又はタンパク質部分と親水性ポリマーの間にあるアミド結合の酵素加水分解に対して安定である精製された複合ペプチド又はタンパク質を得ることが可能であり、そして、生成物由来の分解がなく、薬物に必要な安定性を示す。