本发明公开了一种环脂肽类化合物生物合成基因簇及其激活方法与应用。环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第2972‑101763位核苷酸序列所示。本发明的环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成基因簇相关的所有基因和蛋白信息,可以帮助人们理解环脂肽类化合物Totopotensamides的生物合成机制,为进一步遗传改造提高了材料和知识。另外本发明为通过操控调控基因激活沉默基因簇的表达提供了依据,并丰富了天然产物生物合成基因簇库,为药物先导化合物的发现提供了实体。