Problem to be solved: to provide a medical image processing apparatus for appropriately correcting distortion of an image of a living tissue formed by scanning light.The image to be corrected is generated by arranging a plurality of partial images acquired by receiving light from the tissue continuously and continuously while scanning light on the tissue of the organism.The control section of the medical image processing apparatus executes a position shift amount detection step, a component acquisition step and a correction step.In the position shift amount detection step, the control section detects a positional shift amount between the plurality of partial images (S3).In the component acquiring step, the control section acquires at least the estimated result of the component of the positional deviation quantity caused by the movement of the tissue and the component of the positional deviation quantity caused by the shape of the tissue (S4).In the correction step, the control section corrects the position of each partial image in accordance with the component of the displacement amount (S7).Diagram【課題】光をスキャンすることで生成される生体組織の画像の歪みを適切に補正するための医療画像処理装置を提供する。【解決手段】補正対象画像は、生体の組織上で光をスキャンしつつ、組織からの光を時間的に連続して受光することで取得された複数の部分画像が並べられることで生成されている。医療画像処理装置の制御部は、位置ずれ量検出ステップ、成分取得ステップ、および補正ステップを実行する。位置ずれ量検出ステップでは、制御部は、複数の部分画像の間の位置ずれ量を検出する(S3)。成分取得ステップでは、制御部は、組織の動きに起因する位置ずれ量の成分、および組織の形状に起因する位置ずれ量の成分の少なくともいずれかの推定結果を取得する(S4)。補正ステップでは、制御部は、各々の部分画像の位置を位置ずれ量の成分に合わせて補正する(S7)。【選択図】図5