Disclosed is a method for disinfecting plant cell early samples. The present invention provides a method for producing nanostructured electrolytic water, Disinfecting the initial sample of the plant cell with the nano-acid electrolytic water; And secondary sterilization of the initial sample of plant cell with new nanosphere ionized water after the first disinfection.식물세포 초기 시료의 소독방법이 개시되어 있다. 본 발명은, 물을 전기분해하여 나노산성전리수를 제조하는 단계; 상기 나노산성전리수로 식물세포 초기시료를 1차 소독하는 단계; 및 1차 소독후에, 새로운 나노산성전리수로 식물세포 초기시료를 2차 소독하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 한다.