The present invention relates to methods for increasing homologous recombination of a nucleic acid sequence introduced into a host cell, comprising: (a) introducing into a population of filamentous fungal host cells a first nucleic acid sequence encoding a recombination protein and a second nucleic acid sequence comprising one or more regions which are homologous with the genome of the filamentous fungal host cell, wherein (i) the recombination protein promotes the recombination of the one or more regions with the corresponding homologous region in the hosts genome to incorporate the second nucleic acid sequence by homologous recombination, and (ii) the number of host cells comprising the incorporated second nucleic acid sequence in the population is increased at least 20% compared to the same population without the first nucleic acid sequence (b) and isolating from the population a filamentous fungal cell comprising the incorporated second nucleic acid sequence.La présente invention concerne des méthodes pour augmenter la recombinaison homologue dune séquence dacide nucléique introduite dans une cellule hôte, qui consistent à: a) introduire dans une population de cellules hôtes fongiques filamenteuses une première séquence dacide nucléique codant une protéine recombinante et une seconde séquence dacide nucléique présentant une ou plusieurs régions homologues du génome des cellules hôtes fongiques filamenteuses (ce faisant: i) la protéine recombinante favorise la recombinaison dune ou de plusieurs régions avec la région homologue correspondante dans le génome hôte afin dincorporer la seconde séquence dacide nucléique par recombinaison homologue, et ii) le nombre de cellules hôtes comprenant la seconde séquence dacide nucléique incorporée dans la population est augmentée dau moins 20 % par comparaison avec la même population dépourvue de ladite séquence dacide nucléique) b) isoler de la population une cellule fongique filamenteuse comprenant la seconde séquence dacid