本发明公开了酸性磷酸酶的制备方法。该方法包括使该酸性磷酸酶的编码基因在生物中进行表达的步骤;所述生物为微生物、植物或非人动物;该酸性磷酸酶为a)或b)或c)或d):a)由SEQ ID No.2第1‑203位所示的氨基酸序列组成的蛋白质;b)由SEQ ID No.2第26‑203位所示的氨基酸序列组成的蛋白质;c)在a)或b)的羧基端或/和氨基端融合蛋白标签得到的融合蛋白;d)将SEQ ID No.2或SEQ ID No.6所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的具有酸性磷酸酶活性的蛋白质。本发明可用于培育高效活化土壤磷素养分的生物工程菌。