Provided are an endoscope system and operation method for an endoscope system, whereby it is possible to narrow down to and present a noteworthy index value during diagnosis even when a plurality of index values are used. An image processing unit (60) is provided with an image acquisition unit (70), an extraction unit (72), an index value calculation unit (74), a determination unit (76), a color information setting unit (78), and an image generating unit (80). The image acquisition unit (70) acquires an image captured by an endoscope (12). The extraction unit (72) extracts blood vessels to be observed. The index value calculation unit (74) calculates a plurality of blood vessel index values on the basis of the blood vessels. The determination unit (76) determines whether each of the plurality of blood vessel index values is a normal value or an abnormal value. The color information setting unit (78) sets color information for an abnormal index value, which is a blood vessel index value determined by the determination unit (76) to be an abnormal value, or sets color information for a normal index value, which is a blood vessel index value determined by the determination unit (76) to be a normal value. The image generating unit (80) generates an emphasis image in which blood vessels are emphasized on the basis the color information.L'invention concerne un système d'endoscope et un procédé de fonctionnement pour un système d'endoscope, grâce auxquels il est possible d'affiner une valeur-indice et de présenter une valeur-indice notable pendant un diagnostic même lorsqu'une pluralité de valeurs-indices est mise en œuvre. Une unité de traitement d'image (60) comporte une unité d'acquisition d'image (70), une unité d'extraction (72), une unité de calcul de valeurs-indices (74), une unité de détermination (76), une unité de réglage d'informations de couleur (78), et une unité de génération d'image (80). L'unité d'acquisition d'image (70) acquiert une image capturée par un e
