本发明公开了杏鲍菇枯萎病病原菌的鉴定方法。为了鉴定杏鲍菇枯萎病病原菌,本发明提供了侧耳泛菌特异引物对K3143FR,它由引物K3143F和引物K3143R组成;引物K3143F为SEQ ID No.1所示的单链DNA分子;引物K3143R为SEQ ID No.2所示的单链DNA分子。侧耳泛菌特异引物对K3143FR只在侧耳泛菌的基因组DNA中扩增出了特异条带,在其它菌株中均没有得到扩增产物,侧耳泛菌特异引物对K3143FR可用于快速鉴定侧耳泛菌。本发明为及早地预防和及时地切断侧耳泛菌引起的杏鲍菇枯萎病的传染源及传播途径提供了技术支持,可实现对侧耳泛菌引起的杏鲍菇枯萎病进行早期预防和控制。