本发明涉及刚毛柽柳PHD3转录因子编码基因及其应用,属于植物基因工程育种技术领域。为解决无法利用刚毛柽柳的PHD转录因子编码基因培育优良耐盐植物的问题,本发明提供了刚毛柽柳PHD3转录因子编码基因,即如SEQ ID No:1所示的刚毛柽柳ThPHD3基因的cDNA序列,该cDNA序列编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。构建刚毛柽柳ThPHD3基因的过表达和抑制表达载体,通过瞬时侵染获得转基因刚毛柽柳,试验证实其过表达株系具有明显的耐盐能力。ThPHD3基因的同源和异源过表达结果均表明了该基因能够明显提高转基因植物的耐盐能力,可用于提高植物耐盐性或选育耐盐性转基因植物。