Problem is to analyze blood vessels in a shorter time.The medical image processing apparatus of the embodiment includes a acquiring section, a generating section, and an analysis section.The acquisition part acquires the medical image of the time series including the blood vessel of the subject which has been fluoroscopically taken at least in one direction at a plurality of points.The generating section generates a blood vessel shape model including the time series change information about the blood vessel in the analysis region of the blood vessel based on the medical image of the time series acquired by the acquisition section.The analysis section performs fluid analysis of blood flowing through the blood vessel based on a blood vessel shape model generated by the generating section.Diagram【課題】血管の解析を、より短時間に行うことである。【解決手段】実施形態の医用画像処理装置は、取得部と、生成部と、解析部とを持つ。取得部は、複数の時点で少なくとも一方向から透視撮影した、被検体の血管を含む時系列の医用画像を取得する。生成部は、前記取得部により取得された前記時系列の医用画像に基づいて、前記血管の解析領域における前記血管に関する時系列の変化情報を含む血管形状モデルを生成する。解析部は、前記生成部により生成された血管形状モデルに基づいて、前記血管を流れる血液の流体解析を行う。【選択図】図3