The present invention relates generally to methods and agents for identifying and/or classifying microorganisms (especially bacteria), yeast organisms and filamentous fungi. In particular, the present invention provides for the discovery of unique single nucleotide polymorphisms (SNPs) in bacterial 16S ribosomal RNA (16S rRNA) and yeast organisms and filamentous fungal 18S ribosomal RNA, as well as one or more of those SNPs. A method for classifying and/or identifying bacteria, yeast organisms and/or filamentous fungi in a sample based on their presence. The invention also relates to probes, primers and kits that are useful in those methods.本発明は、微生物(特に細菌)、酵母生物体および糸状菌を同定および/または分類するための方法および薬剤に一般的に関する。詳細には、本発明は、細菌16SリボソームRNA(16S rRNA)ならびに酵母生物体および糸状菌18SリボソームRNAにおける固有の一塩基多型(SNP)の発見、ならびに、それらのSNPの1つまたは複数の存在に基づいて試料中の細菌、酵母生物体および/または糸状菌を分類および/または同定する方法に関する。本発明は、それらの方法において有益であるプローブ、プライマーおよびキットにも関する。