本发明涉及生物医药技术领域,尤其涉及仙台病毒抗原肽组合物及其在仙台病毒感染检测中的应用。本发明提供的仙台病毒抗原肽组合物包括具有SEQ ID NO:1所示序列的多肽、SEQ ID NO:2所示序列的多肽和SEQ ID NO:3所示序列的多肽,或包括在具有如SEQ ID NO:1所示序列中取代、缺失或添加一个或多个氨基酸残基的多肽、在具有如SEQ ID NO:2所示序列中取代、缺失或添加一个或多个氨基酸残基的多肽和在具有如SEQ ID NO:3所示序列中取代、缺失或添加一个或多个氨基酸残基的多肽。本发明提供的仙台病毒抗原肽组合物分子量小,降低了与其他分子发生交叉反应的可能性,提高了检测准确性。