Provided are an endoscope system capable of reliably focusing even when illuminating an observation object with light containing long-wave light, and a method for operating the endoscope system. A moving lens moves in an optical axis direction. A lens driving unit moves the moving lens from a first lens position where the moving lens is focused on the observation object illuminated with short-wave light, to a second lens position where the moving lens focuses on the observation object illuminated with long-wave light having a wavelength longer than that of the short-wave light.L'invention concerne un système d'endoscope capable de focalisation fiable même lors de l'éclairage d'un objet d'observation avec de la lumière contenant une lumière à ondes longues, et un procédé de fonctionnement du système d'endoscope. Une lentille mobile se déplace dans une direction d'axe optique. Une unité d'entraînement de lentille déplace la lentille mobile à partir d'une première position de lentille dans laquelle la lentille mobile est focalisée sur l'objet d'observation éclairé avec une lumière à ondes courtes, à une seconde position de lentille dans laquelle la lentille mobile se focalise sur l'objet d'observation éclairé avec une lumière à ondes longues ayant une longueur d'onde plus longue que celle de la lumière à ondes courtes.長波光を含む光を観察対象に照明する場合であっても、確実にピント合わせをすることができる内視鏡システム及びその作動方法を提供する。移動レンズは、光軸方向に移動する。レンズ駆動部は、短波光で照明された観察対象にピントが合っている場合における移動レンズの第1のレンズ位置から、短波光よりも長波長の長波光で照明された観察対象にピントが合う移動レンズの第2のレンズ位置に、移動レンズを移動させる。