The present invention relates to a filtration device with a biological filtering function and, more specifically, to a filtration device with biological filtering function in which a physical filtration unit, a biological filtration unit and a back-filtration unit are formed in a multi-layer, therefore fresh water flowing from a water tank gradually passes through to the lower layer from the top layer to enable sludge separation and ammonia removal. In the biological filtering unit, by improving inhabited environment of microorganisms, plentiful microorganisms can inhabit, thereby maximizing separation efficiency of ammonia. In the back-filtration unit, fine sludge contained in the fresh water is finally removed so as to supply the filtered fresh water to the water tank.본 발명은 생물학적 여과기능을 갖는 여과장치에 관한 것으로, 더 상세하게는 물리적여과부와, 생물학적여과부 및 역여과부를 다층으로 형성하여 수조로부터의 유입되는 담수물이 상층에서 하층으로 순차적으로 통과시켜 슬러지 분리와 암모니아제거가 이루어지도록 하되, 상기 생물학적여과부에서는 미생물의 서식환경을 개선시켜 다량의 미생물이 서식하게 함으로써 암모니아의 분리효율을 극대화시키고, 역여과부에서는 담수물에 포함되어 있는 미세슬러지를 최종제거하여 여과된 담수물을 수조로 공급하는 생물학적 여과기능을 갖는 여과장치에 관한 것이다.