The present invention relates to a method and system for generating stereoscopic surface images using multi-energy X-ray imaging and optical imaging, and more particularly, to a method and system for generating multi-energy X- dimensional tomographic image of the subject is reconstructed, and a stereoscopic surface model for the subject is calculated. Further, the optical image information including color information and the like for the subject is combined to reconstruct a stereoscopic surface image of the subject And more particularly, to a method and system for generating stereoscopic surface images using multi-energy X-ray imaging and optical imaging.본 발명은 다중 에너지 엑스선 촬영 및 광학 영상을 이용한 입체 표면 영상 생성 방법 및 시스템에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 둘 이상의 다중 에너지 X선 투과 데이터를 이용하여 피검체의 피부를 포함하는 연조직의 대조도(contrast)가 향상된 X선 단층 영상을 재구성하고 상기 피검체에 대한 입체 표면 모델을 산출하며, 나아가 상기 피검체에 대한 색상 정보 등을 포함하는 광학 영상 정보를 결합하여 상기 피검체에 대한 입체 표면 영상을 생성하는 다중 에너지 엑스선 촬영 및 광학 영상을 이용한 입체 표면 영상 생성 방법 및 시스템에 관한 것이다.