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一种达氏鲟性腺差异表达基因GSDF及其筛选方法
- 专利权人:
- 四川省农业科学院水产研究所
- 发明人:
- 陈叶雨,刘亚,龙治海,林珏,龚全,赖见生,杜军,宋明江
- 申请号：
- CN201711262439.1
- 公开号：
- CN107937394A
- 申请日:
- 2017.12.04
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 夏艳
- 摘要：
- 本发明公开了一种达氏鲟性腺差异表达基因GSDF及其筛选方法，属于生物技术领域。本发明利用高通量测序技术对达氏鲟进行雌雄转录组比较测序，对转录组数据进行组装、注释及差异基因的表达分析。利用FPKM法分析雌雄性腺中基因表达水平。使用EBSeq进行基因的差异表达分析，获得雌雄两个样品之间的差异表达基因集。在筛选过程中，选用FDR作为差异表达基因筛选的关键指标，将FDR小于0.05且差异倍数大于等于2作为筛选标准。随后对差异基因进行功能注释，筛选出其中同性别决定相关的基因，为今后达氏鲟性别鉴定，性别决定基因及性别决定机制的研究提供依据。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
