Depletion of Human-enzyme Mediated Homocysteine for the Treatment of Patients with Hyperhomocysteinemia and Homocystinuria Disclosed are methods and compositions for the manipulation of improved proteins having homocysty (te) nase enzyme activity. For example, modified cystathionine- [gamma] -lyase (CGL) enzymes are disclosed that include one or more amino acid substitutions and are capable of degrading homocystine (taine). Also provided are compositions and methods for treating homocystin (taine) depleted homocystinuria or hyperhomocysteinemia using the disclosed enzymes or nucleic acids.고호모시스테인혈증 및 호모시스틴뇨증 환자를 치료하기 위한 인간-효소 매개된 호모시스테인의 고갈호모시스티(테이)나제 효소 활성을 가지는 개선된 단백질의 조작에 관한 방법 및 조성물을 기재한다. 예를 들면, 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하고 호모시스틴(테인)을 분해할 수 있는 변형된 시스타티오닌-γ-라이에이즈 (CGL) 효소들을 개시한다. 또한, 개시된 효소 또는 핵산을 사용하여 호모시스틴(테인) 고갈된 호모시스틴뇨증 또는 고호모시스테인혈증을 치료하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다.